研究人员首先测定了不同小鼠品系的拷贝数如何变化2017-06-29

研究人员首先测定了不同小鼠品系的拷贝数如何变化。他们发现，C57BL/6小鼠品系的平均拷贝数为156，DBA/2J品系为123。CD1的平均拷贝数相似（145），但个体之间的差异要高得多，有些甚至达到两倍。然后研究人员观察了不同组织和器官样本，发现各种组织中mtDNA的拷贝数并未反映出rDNA的拷贝数变化。
为了证实他们的发现与人类癌症有关，研究团队获得了162名个体的全基因组测序数据，他们罹患8种癌症，包括儿童急性淋巴细胞白血病、成神经管细、淋巴瘤、前列腺肿瘤、食管腺癌等。研究人员利用计算PCR分析来测定rDNA拷贝数。他们还获得了143名正常对照个体的全基因组测序数据，以分析rDNA拷贝数。
研究人员表示，骨肉瘤、艾滋相关淋巴瘤和食管腺癌样本中肿瘤基因组的拷贝数明显降低。他们指出，这表明在发展的过程中，某些癌症选择了拷贝数较低的rDNA。他们在其他五种样本中并没有发现明显变化。
根据这些结果，研究人员希望具体讨论mTOR功能是否会影响rDNA的拷贝数。他们利用Pten-/- 白血病的小鼠模型，通过测序和ddPCR分析评估造血干细胞中的rDNA拷贝数。
研究人员证实，造血干细胞中Pten的损失造成通路的mTOR激活，包括磷酸化mTOR、Rps6和S6K1水平更高。更重要的是，研究结果表明，在rDNA减少30-40个拷贝的情况下，造血干细胞生长和核糖体发生仍然可以稳定存在。