研究人员开发了一种基于特异性化学标记的单细胞2017-07-04

研究人员开发了一种基于特异性化学标记的单细胞、单碱基分辨率的5fC测序技术（CLEVER-seq），并将其应用于小鼠着床前胚胎以及哺乳动物多能干细胞的5fC检测。研究发现，在小鼠早期胚胎发育过程中，5fC发生高度动态变化并富集在基因表达调控区域。5fC在不同的胚胎发育阶段以及多能干细胞中具有高度的异质性。
研究人员已经发现骨髓恶性的严重程度会不断增加，从前体血细胞的癌前突变开始，然后发展为骨髓疾病，并最终发展成为急性骨髓性白血病。来自西奈山伊坎医学院的研究人员的研究人员收集了来自各种阶段骨髓恶性患者的细胞（包括恶化前细胞），将其重编程了癌前状态的多能干细胞形式，然后再把这些细胞分化成为血细胞，构建出了代表特定疾病阶段的细胞系，由此来追踪疾病的进程。
研究人员发现重编程过程中，虽然RBP DDX5的表达逐步上升，但却发挥着抑制重编程的作用。DDX5功能缺失通过影响微小RNA(microRNA)125b的表达水平，从而上调非经典PRC1复合物里的RING1和YY1结合蛋白(RYBP)的表达水平。DDX5功能缺失和RYBP过表达在重编程早期影响间质细胞向上皮细胞转变，在重编程晚期影响多能性基因的激活。研究发现，DDX5功能缺失上调RYBP，从而进一步促进了组蛋白H2A赖氨酸K119位点的泛素化(H2AK119ub1)的水平，并促进H2AK119ub1富集到部分胚层分化特异基因的转录起始位点上，并抑制这类基因的表达。