研究人员首先测定了不同小鼠品系的拷贝数如何变化2017-07-05
研究人员以三个小鼠品系(C57BL/6、DBA/2J和CD1 )为研究对象,从不同的器官中获得了15个组织样本,并提取出基因组DNA。然后,他们按照Bio-Rad的微滴式数字PCR方案,测定了rDNA的拷贝数。
研究人员首先测定了不同小鼠品系的拷贝数如何变化。他们发现,C57BL/6小鼠品系的平均拷贝数为156,DBA/2J品系为123。CD1的平均拷贝数相似(145),但个体之间的差异要高得多,有些甚至达到两倍。然后研究人员观察了不同组织和器官样本,发现各种组织中mtDNA的拷贝数并未反映出rDNA的拷贝数变化。
研究人员希望具体讨论mTOR功能是否会影响rDNA的拷贝数。他们利用Pten-/- 白血病的小鼠模型,通过测序和ddPCR分析评估造血干细胞中的rDNA拷贝数。
研究人员证实,造血干细胞中Pten的损失造成通路的mTOR激活,包括磷酸化mTOR、Rps6和S6K1水平更高。更重要的是,研究结果表明,在rDNA减少30-40个拷贝的情况下,造血干细胞生长和核糖体发生仍然可以稳定存在。总而言之,癌症中的rDNA拷贝数和序列可能发生变化,”研究人员写道。“我们推测,这种拷贝数的测定可以作为PI3K-AKT-mTOR通路中各种突变的检测器,以及DNA损伤药物是否选择性靶定癌症干细胞的预测工具。”
推荐文章