磁珠法动物组织基因组 DNA 提取的常见问题及参考意见2018-09-26
带你了解动物组织基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)说明书
规格:50T
保存:磁珠可以在室温下( 15-25℃)运输,但请在 4℃冰箱中保存,禁止冻存。蛋白酶 K 需-20℃保存,以保证其活性。其余试剂可以室温保存,更长时间的保存可置于 2-8℃。复检期 1 年。
产品说明:
本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和缓冲液系统,可从样品中分离纯化高质量基因组DNA。特殊包被的磁珠在一定条件下对目的 DNA 具有很强的亲和力,而当条件改变时,磁珠释放吸附的 DNA,能够达到快速分离纯化 DNA 的目的。整个过程安全、便捷,提取的 DNA 纯度高。使用本试剂盒纯化的基因组 DNA 的 OD260/OD280 均在 1.7-1.9 之间,可以应用于各类下游分子生物学实验。使用前请先在漂洗液中配置 70%乙醇。若裂解液产生沉淀,使用前应将试剂盒内的溶液在室温放置一段时间,必要时可在 37℃水浴中预热 10min 溶解沉淀,摇匀后使用。
注意事项:
1. 动物组织(脾、肺、肾)要用液氮充分研磨。
2. 整个裂解过程操作尽量温和,并在要求时间内完成。
3. 如果组织液浓度较高,则建议磁珠量可适当增加,以获取高浓度 DNA。
4. 客户自备试剂:异丙醇、无水乙醇、蛋白酶 K。
5. 使用前请在漂洗液瓶中预先配制 70%乙醇。
6. 磁珠在使用前一定要充分混匀。
常见问题及参考意见:
1. 得率低
(1)组织没有完全裂解完,裂解时间不够或没有离心直接进行下一步操作:可适当延长裂解时间,zui长不超过60 min。样品裂解后,请一定要离心后再进行下一步操作。
(2)结合不充分:结合过程中要使磁珠一直处于悬浮状态,并且充分颠倒混匀。
(3)取样量大于说明书给出量:取样量请严格按照说明书操作。
2. 条带弥散
(1)样品不新鲜或反复冻融多次:尽量用新鲜样品进行实验,如果样品需要保存,可根据实验,分装保存样品,尽量避免反复冻融;
(2)环境温度太高:可以将研钵置于-20℃预冷或置于液氮保存后再进行研磨,如果所提取材料基因组DNA极易降解,可用液氮研磨;
(3)裂解时间太长:裂解时间不要超过60 min;
(4)提取后模板DNA放置时间太长:提取后如有需要,请尽量及时进行凝胶电泳实验。短期内可置于4℃保存,长期请置于-20℃保存(尽量注意避免反复冻融)。
3. DNA液有颜色
(1)洗涤过程不充分:如果结合后磁珠呈团状、 丝状或颗粒状,可增加点阵力度及次数,充分吹打混匀。
(2)裂解不充分:适当增加裂解液S1和S2用量,也可以延长裂解时间。
(3)样品用量大于说明书给出量而其他试剂用量没有相应调整:严格按照说明书操作,如果需要增大样本量,可以等比例增加裂解液S1、S2以及磁珠用量,其他试剂用量不变。
4. DNA样品不纯,干扰后续实验
(1)DNA液有乙醇残留:洗涤时,请注意吸净管盖及管底的残液。此外,磁珠应完全干燥,保证无乙醇残留。
(2)磁珠洗涤不充分:加入70%乙醇溶液时,请吸打或点阵混匀。如有必要,可增加一次洗涤步骤。
(3)DNA液中吸入磁珠:如果不小心吸入磁珠,请将上清液返回原管,待磁珠完全吸附至管壁后重新吸取上清。或者将吸取的上清液10000 rpm离心2 min,再取上清。
(4)DNA液中含有蛋白质等杂质:建议适当减少样品用量。或可重复一次提取过程去除杂质。
(5)DNA液中含有轻微盐离子等杂质,此为洗脱液(含有抑制核酸降解的成分)正常现象,不影响实验,可将获得的DNA置于-20℃环境分装保存。
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